根据目前由部长们确认的改革方向，本次机构改革所涉及部门的职权多有交叉又各有侧重。

对当前部门体制的“不得不改”，郑新立以互联网、电话网、广电网“三网融合”的推进难度进行解析。他曾参与制定的“九五”、“十五”、“十一五”规划均将“三网融合”写入。但该问题始终未有突破，因为“涉及的广电总局和信产部有各自的利益，而运营商的利益又有主管部门作后台”。

单纯从部门构成和权限看，目前的国家发改委无疑是典型的“大部”———其下设司局逾20个，人称“小国务院”。但“发改委模式”并非本轮改革的方向。

事实上，十七大已为“大部制”方向做出明确定位：“解决机构重叠、职责交叉、政出多门”，并直言“减少政府对微观经济运行的干预”。这被各方普遍解读为“政府将全面退出微观管理领域的先声”。

作为十七大报告的起草人之一，郑新立认为：这正是本轮改革的重心，即“政府的归政府，市场的归市场”。行政体制改革最重要的是实现政府自身的转型。其中有两大任务：一是由管制型政府转向服务型政府。二是由经济建设型政府转到一个公共治理型政府。

国家行政学院副院长袁曙宏亦认为，“政府职能转变是深化行政管理体制改革的核心。要切实加快政府职能转变，解决好政府应当做什么的问题”。“今后5年是我国经济社会发展和全面建设小康社会的重要时期，也是深化行政管理体制改革承前启后的关键时期。”袁曙宏说。